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                    中國生物多樣性數據集專題 II 區論文(已發表) ? 版本 ZH3 Vol 5 (3) 2020
                    下載
                    滇西北縣域種子植物名錄數據集
                    The catalogue of county-level seed plants in northwest Yunnan
                    ?>>
                    : 2020 - 04 - 22
                    : 2020 - 08 - 26
                    : 2020 - 04 - 30
                    : 2020 - 09 - 22
                    极速快三
                    3812 28 0
                    摘要&關鍵詞
                    摘要:滇西北處于全球生物多樣性熱點地區之一橫斷山的南端,植物多樣性豐富,然而植物空間分布數據仍較為欠缺,沒有縣域分布數據。通過整合涉及滇西北的植物志書、野外科考報告、區域性生物多樣性專著、國內外分類學學術期刊發表的新類群和新記錄、各大標本館及公共數據庫等資料,參照最新的分子系統學和分類學成果,構建滇西北縣域種子植物名錄數據集。本數據集由滇西北16個縣的縣域被子植物和裸子植物物種名錄組成,包含拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、學名、中文名、縣名7個類型字段信息,共5866種(含種下等級)。本名錄可以為滇西北豐富的種子植物多樣性的研究和保護提供數據支持。
                    關鍵詞:滇西北;種子植物;縣域;名錄
                    Abstract & Keywords
                    Abstract:?Located in the southern part of Hengduan Mountains, northwest Yunnan is one of the world’s biodiversity hotspots. However, despite its rich plant diversity, the region has been understudied as a locus for plant data acquisition, especially when it comes to county level. In this study, we built a catalogue of county-level seed plants in northwest Yunnan by reference to the latest molecular systematics and taxonomy, based on an integrated study of existing literature (including floras, fieldwork reports, monographs, and other scholarly works), specimen archives and public databases. This dataset is a checklist of 5,866 seed plant species from 16 counties of northwest Yunnan, including seven information categories, namely, order name in Latin, order name in Chinese, family name in Latin, family name in Chinese, scientific name, Chinese name, and county-level distribution data. It has practical value for the conservation of rich seed plant species in northwest Yunnan.
                    Keywords:?northwest Yunnan;?seed plants;?county-level;?catalogue
                    數據庫(集)基本信息簡介
                    數據庫(集)名稱滇西北縣域種子植物名錄數據集
                    數據作者李文慶、尹昭吉、陳凱云、陳家輝
                    數據通信作者陳家輝(chenjh@mail.cn)
                    地理區域滇西北(24°38′–29°15′N,98°05′–101°16′E),其中包括:隆陽區、騰沖市、瀘水縣、福貢縣、貢山縣、維西縣、蘭坪縣、云龍縣、劍川縣、洱源縣、大理市、漾濞縣、玉龍縣、香格里拉市、德欽縣、寧蒗縣。
                    空間分辨率縣級
                    數據量371 KB,合計總數據量5867條
                    數據格式*.xlsx
                    數據服務系統網址http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/979
                    基金項目生態環境部,生物多樣性調查評估項目(2019HJ2096001006)
                    數據庫(集)組成數據集包括滇西北地區種子植物56目185科1233屬5866種,其中被子植物53目181科1218屬5822種(含種下等級),裸子植物3目4科15屬44種(含種下等級)。數據內容由7部分組成,分別為拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、學名、中文名、縣名。
                    Dataset Profile
                    TitleThe catalogue of county-level seed plants in northwest Yunnan
                    Data corresponding authorChen Jiahui (chenjh@mail.kib.ac.cn)
                    Data author(s)Li Wenqing, Yin Zhaoji, Chen Kaiyun, Chen Jiahui
                    Geographical scope24°38’N – 29°15’N, 98°05’E – 101°16’E; specific areas include: Longyang district, Tengchong county, Lushui county, Fugong county, Gongshan county, Weixi county, Lanping county, Yunlong county, Jianchuan county, Eryuan county, Dali county, Yangbi county, Yulong county, Shangri-la county, Deqin county, Ninglang county.
                    Spatial resolutionCounty-level
                    Data volume371 KB, with 5,867 data entries in total
                    Data format*.xlsx
                    Data service system<http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/979>
                    Source of fundingThe Biodiversity Survey and Assessment Project of the Ministry of Ecology and Environment of China (Grant No. 2019HJ2096001006).
                    Dataset compositionThis dataset covers seed plants of 5,866 species (including infraspecies) affiliated to 1,233 genera, 185 families under 56 orders, including 5,822 species of angiosperms affiliated to 1,218 genera, 181 families under 53 orders, and 44 species of gymnosperms affiliated to 15 genera, 4 families under 3 orders. The dataset includes such information as the plants’ order name in Latin, order name in Chinese, family name in Latin, family name in Chinese, species name in Latin, species name in Chinese and county-level distribution information.
                    引 言
                    滇西北地處青藏高原南緣,屬于橫斷山的南端,特殊的地質地貌、復雜多樣的氣候類型與縱橫交錯的河網水系,使該地區成為我國乃至世界生物多樣性豐富和獨特的地區之一[1]。該地區位于云南省西北部,在行政區劃上包括迪慶藏族自治州、怒江傈僳族自治州、麗江市、保山市和大理白族自治州。在《中國生物多樣性保護戰略與行動計劃》(2011?2030年)中,滇西北是8個優先保護區域之一的西南高山峽谷區的主要組成區域。此外,在《中國的生物多樣性:現狀及其保護對策》[2]中,滇西高山峽谷地區是我國14個具有國際意義的陸地生物多樣性關鍵地區之一。滇西北面積為79800 km2,占比不到國土面積的1%,卻擁有全國約三分之一的高等植物,然而生物多樣性空間分布數據卻十分欠缺[3]。
                    生物物種名錄是一個自然地理區域或行政單元生物區系本底性的基礎資料[4],物種名錄編制是一個需要及時更新的動態過程。2006年完成的《云南植物志》[5]、2004年完成的《中國植物志》[6]和2013年完成的第二版《Flora of China》(50卷)[7],反映了學者們對云南包括滇西北地區高等植物認識的階段性成就,在一定程度上補充和完善了對云南植物物種多樣性的認識。然而,區域性(滇西北等)生物多樣性評估非常有限,物種精確的分布、狀態和變化趨勢大都不清楚[8-9]。加之隨著近年來對滇西北地區生物多樣性調查和研究的深入,大量的新分類群和新記錄物種的發現和發表,以及分類學和系統學的深入研究導致大量科、屬和種范圍界定和系統位置發生變化等原因[10],編制滇西北種子植物名錄并建立及時更新制度與平臺,對于區域性生物多樣性研究和保護與利用實踐都是十分重要的。
                    1 ? 數據采集和處理方法
                    1.1 ? 數據源
                    滇西北縣域種子植物名錄數據集的主要來源于《云南植物志》各卷冊[5]和《云南種子植物名錄》[10],同時補充:
                    (1)區域性植物志書和生物多樣性專著:如《中國植物志》[6]、《Flora of China》[7]、《云南省生物物種名錄(2016版)》[11]、《云南生物物種紅色名錄(2017版)》[12]、《青藏高原維管植物及其生態地理分布》[13]和《橫斷山區維管植物》[14]等。
                    (2)文獻:國內外分類學學術期刊發表的涉及到滇西北區域的類群的分類學修訂以及該區域有分布的新類群和新記錄。
                    (3)標本館及公共數據庫:收集中國科學院昆明植物研究所標本館(KUN)、中國科學院植物研究所標本館(PE)、中國科學院成都生物研究所植物標本館(CDBI)、中國科學院西北高原生物研究所植物標本館(QTPMB)、四川大學植物標本館(SZ)、西藏高原生物研究所標本館、云南大學標本館(PYU)等高校和科研院所滇西北高等植物的館藏標本信息,以及中國數字植物標本館(CVH,http://www.cvh.org.cn),中國國家標本資源平臺(NSII,http://www.nsii.org.cn/),全球生物多樣性信息網絡(GBIF,https://www.gbif.org/)等分類學公共網絡數據平臺的滇西北高等植物的標本信息,完善縣域分布。
                    (4)補充和更新近年的野外考察成果和專家建議。
                    將通過以上各種數據源整合得到的種子植物名錄和地理分布的集合數據錄入EXCEL,以方便后期處理。
                    1.2 ? 數據處理
                    (1)異名處理
                    通過Tropicos(http://www. tropicos.org/)、物種2000(http://www.sp2000.cn/joaen/index.php)、Flora of China(http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2)等數據庫平臺對整合的種子植物名錄集合數據中的科名和學名進行核對[15-16],具體的處理細過程詳見陳家輝等(2018)[10]文獻。
                    (2)分類系統
                    參照最新的分子系統學和分類學成果決定啟用的名稱和系統位置,裸子植物和被子植物的分類系統分別以采用克氏系統和APG Ⅳ系統為基礎,但也有所修訂,詳見陳家輝等(2018)[10]文獻。
                    (3)種下等級處理
                    為了細化植物多樣性,采用變種或亞種的概念。當一個種的種下有2個以上的亞種或變種,若僅僅是某變種/亞種(包括原變種/亞種)分布于滇西北,則僅收錄該變種/亞種[10]。
                    (4)提取地理分布
                    從上述已經進行異名處理后的種子植物數據集中按照地理分布信息分別提取出隆陽區、騰沖市、瀘水縣、福貢縣、貢山縣、維西縣、蘭坪縣、云龍縣、劍川縣、洱源縣、大理市、漾濞縣、玉龍縣、香格里拉市、德欽縣、寧蒗縣這16個縣域中的被子植物和裸子植物名錄數據,最終形成滇西北地區縣域種子植物名錄數據集。針對歷史采集信息,存在許多地點描述不規范和信息缺失的問題,同時考慮我國行政區劃在不斷發生更替(如中甸變更為香格里拉市等),早期的很多地名已經發生變化[17],因此還進行了手工逐條校對并更正。
                    (5)中文名選用原則
                    選用的類群中文名首先依據《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》所記載的中文名,對于沒有記載或者匹配失敗的物種名稱,依次選用《Flora of China》、《云南植物志》。
                    2 ? 數據樣本描述
                    數據集合計總數據量為5867條,每條目包含一個縣級分布地,具體包括滇西北地區種子植物56目185科1233屬5866種,其中被子植物53目181科1218屬5822種(含種下等級),裸子植物3目4科15屬44種(含種下等級)。數據內容由7部分組成,分別為拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、學名、中文名、縣名(見圖1)。


                    圖1 ? 滇西北種子植物數據集
                    3 ? 數據質量控制和評估
                    為了對數據質量進行控制和評估,我們采用工作組初審和專家會審和函評的工作流程。初審主要由工作組完成,即根據以上原則對滇西北記錄的所有物種名稱進行逐一審核。邀請云南省內外有關分類學專家參加專家審核會,專家組成員提出質疑,再由工作組成員根據專家意見進行審核和修改。對一些從事??茖傺芯康膶<?,則采用通過電子郵件發送邀請函的方式請專家對相應的科屬進行審核。由專家出具書面審核意見和建議,工作組再根據專家的審核意見和建議進行修改、調整和完善。
                    4 ? 數據價值
                    滇西北是中國西南山地這一全球生物多樣性熱點地區的核心區域,但其生態環境十分脆弱、經濟社會發展相對滯后,進行該區域植物多樣性摸底調查對于這一重要區域的生物多樣性保護和科學利用是十分必要的。本數據集可以為掌握生物多樣性空間分布規律和明確滇西北地區植物保護空缺提供數據支持,為提出優先區域生物多樣性的保護與監管對策以及政府決策提供依據和基礎資料,為我國未來開展大尺度的生物多樣性本底調查與評估提供案例。
                    致 謝
                    感謝參與滇西北種子植物名錄編目的工作組付出的時間和精力,感謝所有專家組成員提供的悉心指導和寶貴建議。
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                    數據引用格式
                    李文慶, 尹昭吉, 陳凱云, 等. 滇西北縣域種子植物名錄數據集[DB/OL]. Science Data Bank, 2020. (2020-04-22). DOI: 10.11922/sciencedb.979.
                    稿件與作者信息
                    論文引用格式
                    李文慶, 尹昭吉, 陳凱云, 等. 滇西北縣域種子植物名錄數據集[J/OL]. 中國科學數據, 2020, 5(3). (2020-09-18). DOI: 10.11922/csdata.2020.0023.zh.
                    李文慶
                    Li Wenqing
                    主要承擔工作:數據收集與分析。
                    (1990—),女,云南人,碩士,研究實習員,研究方向為植物地理與遙感。
                    尹昭吉
                    Yin Zhaoji
                    主要承擔工作:項目管理、數據收集與分析。
                    (1997—),男,云南人,學士,助理工程師,研究方向為計算機。
                    陳凱云
                    Chen Kaiyun
                    主要承擔工作:數據收集與分析。
                    (1990—),男,云南人,碩士,研究實習員,研究方向為植物分類。
                    陳家輝
                    Chen Jiahui
                    主要承擔工作:項目組織、管理與數據審核。主要承擔工作:項目管理、數據收集與分析。
                    chenjh@mail.kib.ac.cn
                    (1977—),男,江西人,博士,副研究員,研究方向為植物分類學與系統演化。
                    出版歷史
                    I區發布時間:2020年4月30日 ( 版本ZH2
                    II區出版時間:2020年9月22日 ( 版本ZH3
                    參考文獻列表中查看
                    中國科學數據
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